Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms