Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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