Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms