Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CBFBQ13951 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms