Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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