Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMPD1P17405 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms