Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms