Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms