Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms