Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms