Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1BQ9UPS6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms