Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms