Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
KDM5BQ9UGL1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms