Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NXF1Q9UBU9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms