Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ARHGEF12Q9NZN5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms