Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms