Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ALKBH4Q9NXW9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms