Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC52A1Q9NWF4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms