Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms