Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMSN1Q9NSI8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms