Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX15Q9NRS6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms