Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms