Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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LHX9Q9NQ69 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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