Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms