Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3N1

TMX1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1Q9H3N1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX1Q9H3N1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms