Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNMDQ9H2S6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms