Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms