Protein–RNA interactions for Protein: Q9H165

BCL11A, B-cell lymphoma/leukemia 11A, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11AQ9H165 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCL11AQ9H165 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms