Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms