Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms