Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms