Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SETD2Q9BYW2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SETD2Q9BYW2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms