Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms