Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms