Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms