Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms