Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF559Q9BR84 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms