Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FERMT1Q9BQL6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FERMT1Q9BQL6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms