Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms