Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYD88Q99836 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYD88Q99836 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms