Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP19Q99542 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms