Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSF3RQ99062 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms