Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSRNP1Q96S65 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms