Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms