Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms