Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms