Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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