Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms