Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EAF1Q96JC9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms