Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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